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某药物研发公司的高性能计算药物筛选算力服务器解决方案

背景需求 #

某领先的药物研发公司致力于加速新药开发过程,特别是在抗癌药物的发现和分子对接研究方面。他们的研究需要通过高通量计算模拟和分子动力学分析,筛选数以百万计的化合物。现有的计算资源已经无法支撑这一密集的计算需求,迫切需要一套强大且稳定的算力服务器解决方案,以提高药物筛选的效率和准确性。

需求分析 #

  1. 超强计算能力:支持大规模分子对接和分子动力学模拟,快速筛选潜在药物分子。
  2. 大容量显存和高带宽:处理复杂的分子模拟和海量数据传输。
  3. 高稳定性:能够长时间在高负载下持续运行,确保实验的连续性和结果的可靠性。
  4. 灵活扩展性:支持未来更大规模计算任务和更多模拟场景。

解决方案 #

我们为该药物研发公司提供了“网昱”品牌的定制化算力服务器解决方案,具体配置如下:

  • 主板平台:Supermicro SYS-4029GP-TRT,支持多GPU高密度计算,专为高性能计算任务设计。
  • CPU:2颗Intel Xeon Platinum 8280,56核心,112线程,频率高达2.7GHz,专为高并发计算任务优化。
  • GPU显卡:8块NVIDIA RTX 4090,每块显卡配备24GB GDDR6X显存,能够处理复杂的分子模拟和深度学习任务。
  • 内存:1.5TB DDR4 ECC内存,确保在大规模分子动力学模拟中提供足够的计算空间和速度。
  • 存储:10TB NVMe SSD用于系统和关键数据的高速存取,40TB SATA HDD用于存储大量分子模拟数据和筛选结果,确保数据安全与容量需求。
  • 网络:双100GbE高速网卡,确保数据在不同计算节点间的高速传输,减少延迟,提升计算效率。
  • 电源:冗余3200W电源,确保系统在长时间高负载下的稳定运行,不间断支持药物研发工作。
  • 散热系统:定制液冷系统,保障服务器在高密度计算环境中的温度控制,避免因过热导致的性能下降。

效果与成果 #

部署新服务器后,该药物研发公司在药物筛选和分子动力学模拟方面取得了显著进展:

  1. 药物筛选效率提高:原本需要数周时间的化合物筛选,现在仅需数天即可完成,大幅缩短了新药开发周期。
  2. 模拟精度提升:高精度的分子动力学模拟大大提高了药物与靶点的匹配率,减少了实验室验证的时间和成本。
  3. 系统稳定性:服务器在持续高负载下表现稳定,确保了每一项实验计算任务的顺利完成,没有出现任何数据丢失或计算中断的情况。
  4. 未来扩展性:新服务器的灵活扩展能力为后续更大规模的药物筛选和更复杂的模拟研究提供了保障。

总结 #

通过为该药物研发公司提供定制化的算力服务器解决方案,网昱品牌的服务器成功满足了他们在新药研发中的高性能计算需求,大幅提升了研发效率和成功率。此次案例展示了高性能算力服务器在药物研发领域的关键作用,为其他药物研发机构提供了有效的参考。